Las pipas de calabaza se pueden consumir crudas, secas, ligeramente tostadas… Tienen un sabor dulce, agradable y aportan un toque crujiente.
 
Se utilizan para dar vistosidad a pasteles, productos de bollería y platos salados. Incluso son muy ricas como complemento a los cereales del desayuno. Se comen mucho como aperitivo y en México se utilizan para espesar salsas.
 
Por sus características se pueden usar como un fruto seco, para pralinés (dulces o salados dan mucho juego en la cocina), majados, mousses, helados, aderezos, crocantes…
 
Hay varias formas de prepararlas para convertir las pipas de calabaza en un aperitivo delicioso, además de poder incluirlas en ensaladas, en salsas, en vinagretas, en la elaboración de pan, bizcochos, magdalenas, galletas, etc.
 
También se utilizan para preparar una variedad de mole conocido como pepian o pipián y pueden ser aglomeradas para formar una palanqueta.